Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP6Q6ZN66 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms