Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms