Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms