Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAAP20Q6NZ36 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP20Q6NZ36 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms