Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ParpbpQ6IRT3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms