Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT39Q6A163 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms