Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP1BQ659C4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms