Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms