Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HABP4Q5JVS0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HABP4Q5JVS0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms