Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms