Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP29Q52LW3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP29Q52LW3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms