Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK7Q16549 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms