Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RPE65Q16518 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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RPE65Q16518 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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