Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK4Q16099 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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