Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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