Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUM3Q15397 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
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