Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRF5Q13568 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms