Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD1Q13393 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PLD1Q13393 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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PLD1Q13393 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD1Q13393 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms