Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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