Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3FQ13275 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3FQ13275 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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