Protein–RNA interactions for Protein: Q13166

CATR1, CATR tumorigenic conversion 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATR1Q13166 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CATR1Q13166 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATR1Q13166 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms