Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms