Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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