Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWF1Q12792 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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TWF1Q12792 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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