Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YPR077CYPR077C 372 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 SQS1YNL224C 2304 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 VPS33YLR396C 2076 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 CAF130YGR134W 3369 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 PPQ1YPL179W 1650 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 SPH1YLR313C 1593 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 PKP2YGL059W 1476 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 SRB7YDR308C 423 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YGL214WYGL214W 486 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 VMA7YGR020C 357 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 TAM41YGR046W 1158 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 FOL2YGR267C 732 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YIR014WYIR014W 729 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YOL106WYOL106W 354 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 GRX7YBR014C 612 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 PBP2YBR233W 1242 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 AUS1YOR011W 4185 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 NOG1YPL093W 1944 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 RRP5YMR229C 5190 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 CBS2YDR197W 1170 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 PET54YGR222W 882 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 DOG1YHR044C 741 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 PHD1YKL043W 1101 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 COQ5YML110C 924 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 IMP1YMR150C 573 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 CPA2YJR109C 3357 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 AI4Q0065 1671 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 SKN7YHR206W 1869 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 FRE4YNR060W 2160 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 AEP2YMR282C 1743 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 WHI3YNL197C 1986 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 ENA2YDR039C 3276 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 ENA1YDR040C 3276 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 RRP42YDL111C 798 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 MGT1YDL200C 567 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 DET1YDR051C 1005 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 TGL2YDR058C 981 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 RGI1YER067W 486 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 CGR1YGL029W 363 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YGL230CYGL230C 444 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YGL242CYGL242C 546 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 SNX4YJL036W 1272 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 OCA2YNL056W 594 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 RAS1YOR101W 930 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC39Q12745 YDR089WYDR089W 2610 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RUB1YDR139C 234 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 SCM4YGR049W 564 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 CCE1YKL011C 1062 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 SWD2YKL018W 990 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YKL131WYKL131W 522 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 DLT1YMR126C 1029 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YNL320WYNL320W 855 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 VAM10YOR068C 345 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 DIM1YPL266W 957 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 SPO71YDR104C 3738 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RNR1YER070W 2667 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 Q0255Q0255 1419 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 JEN1YKL217W 1851 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YML096WYML096W 1578 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 MIP6YHR015W 1980 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 CDC45YLR103C 1953 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YIR040CYIR040C 333 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 PBA1YLR199C 831 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 ILV5YLR355C 1188 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 END3YNL084C 1050 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 PEX15YOL044W 1152 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 IPP1YBR011C 864 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 DGA1YOR245C 1257 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 VPS30YPL120W 1674 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 VPS53YJL029C 2469 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 EBS1YDR206W 2655 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 GCD2YGR083C 1956 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 CDC5YMR001C 2118 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 PHO81YGR233C 3537 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 CCM1YGR150C 2595 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 CWC23YGL128C 852 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 OST5YGL226C-A 261 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 COX6YHR051W 447 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YHR097CYHR097C 1101 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 SVP26YHR181W 687 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RPS28BYLR264W 204 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 UNG1YML021C 1080 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 TEM1YML064C 738 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YPR027CYPR027C 834 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 VTC4YJL012C 2166 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 SEC27YGL137W 2670 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 ETP1YHL010C 1758 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 DPP1YDR284C 870 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RPL30YGL030W 318 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 LIF1YGL090W 1266 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RGI2YIL057C 495 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 COQ9YLR201C 783 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 YMR087WYMR087W 855 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC39Q12745 RPL13BYMR142C 600 nt3.49□□□□□ -1.85
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