Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 RED1YLR263W 2484 nt2.78□□□□□ -1.96
MSH5Q12175 PKP2YGL059W 1476 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RIX1YHR197W 2292 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 GYL1YMR192W 2163 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 NOP4YPL043W 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 CET1YPL228W 1650 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YCR085WYCR085W 354 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RPL35BYDL136W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YGR064WYGR064W 369 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 EFG1YGR271C-A 702 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YHR097CYHR097C 1101 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YIL024CYIL024C 570 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YIL174WYIL174W 228 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YBL028CYBL028C 321 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 GPI2YPL076W 843 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 NIP7YPL211W 546 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 PIN3YPR154W 648 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 TPO5YKL174C 1857 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 NFT1YKR103W 3657 nt2.77□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 BEM4YPL161C 1902 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 DIA2YOR080W 2199 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 CPR1YDR155C 489 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 DDI2YFL061W 678 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YGR017WYGR017W 894 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 TYS1YGR185C 1185 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YHL005CYHL005C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 PRP8YHR165C 7242 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 DCG1YIR030C 735 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 REC102YLR329W 795 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RPS10AYOR293W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ATG29YPL166W 642 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YPR027CYPR027C 834 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ADY4YLR227C 1482 nt2.76□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 MET5YJR137C 4329 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ESC1YMR219W 4977 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 HEH2YDR458C 1992 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RDI1YDL135C 609 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SOL3YHR163W 750 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YJL175WYJL175W 513 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 HMX1YLR205C 954 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 TRM112YNR046W 408 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 snR34snR34 203 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SRO77YBL106C 3033 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YLR001CYLR001C 2589 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YNR063WYNR063W 1824 nt2.75□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ESL2YKR096W 3588 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SKT5YBL061C 2091 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 EXO70YJL085W 1872 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YDL050CYDL050C 372 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ADH4YGL256W 1149 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 PAU13YHL046C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 TEM1YML064C 738 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ATP11YNL315C 957 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YPL071CYPL071C 471 nt2.74□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 VAC14YLR386W 2643 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 PSK1YAL017W 4071 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SEC27YGL137W 2670 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 TSC13YDL015C 933 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YDL186WYDL186W 834 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YGR114CYGR114C 390 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RPL14BYHL001W 417 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 DID4YKL002W 699 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YLR076CYLR076C 423 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 MCA1YOR197W 1299 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 MUM2YBR057C 1101 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 POL30YBR088C 777 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YSA1YBR111C 696 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 MRS2YOR334W 1413 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 CDC55YGL190C 1581 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SOK1YDR006C 2706 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 GYP7YDL234C 2241 nt2.73□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 CLN2YPL256C 1638 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 CYR1YJL005W 6081 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ERP3YDL018C 678 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RPN4YDL020C 1596 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RRG1YDR065W 1098 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 ARI1YGL157W 1044 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YGR073CYGR073C 372 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SGN1YIR001C 753 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 RPL6AYML073C 531 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 VPS9YML097C 1356 nt2.72□□□□□ -1.97
MSH5Q12175 SAD1YFR005C 1347 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 MPS1YDL028C 2295 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 SPH1YLR313C 1593 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 SWC4YGR002C 1431 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 ISC10YER180C 804 nt2.71□□□□□ -1.98
MSH5Q12175 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.71□□□□□ -1.98
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