Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms