Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC15Q0P6D6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC15Q0P6D6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms