Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms