Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC2Q02487 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms