Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms