Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD1P98174 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD1P98174 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD1P98174 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD1P98174 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGD1P98174 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGD1P98174 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGD1P98174 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD1P98174 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms