Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTCP1P56278 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms