Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BGRP55822 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms