Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF1P55201 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms