Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 SFH1YLR321C 1281 nt3.66□□□□□ -1.82
HEF3P53978 TRM112YNR046W 408 nt3.66□□□□□ -1.82
HEF3P53978 YBR242WYBR242W 717 nt3.66□□□□□ -1.82
HEF3P53978 ROG1YGL144C 2058 nt3.66□□□□□ -1.82
HEF3P53978 ISW2YOR304W 3363 nt3.65□□□□□ -1.82
HEF3P53978 RGC1YPR115W 3252 nt3.65□□□□□ -1.82
HEF3P53978 CUE3YGL110C 1875 nt3.65□□□□□ -1.82
HEF3P53978 SEC59YMR013C 1560 nt3.65□□□□□ -1.82
HEF3P53978 CBS2YDR197W 1170 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YDR535CYDR535C 501 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YGL117WYGL117W 798 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 PET130YJL023C 1044 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YMR099CYMR099C 894 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SSO2YMR183C 888 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPB8YOR224C 441 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 ILS1YBL076C 3219 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 CTM1YHR109W 1758 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 STE6YKL209C 3873 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YDR131CYDR131C 1671 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 FUN12YAL035W 3009 nt3.65□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RNT1YMR239C 1416 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YPL109CYPL109C 1974 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 PHM6YDR281C 315 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 APA2YDR530C 978 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPL23BYER117W 414 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YGL204CYGL204C 306 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YGL230CYGL230C 444 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 FMP41YNL168C 780 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 IPP1YBR011C 864 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 TPK2YPL203W 1143 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 ACK1YDL203C 1872 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 COM2YER130C 1332 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SYT1YPR095C 3681 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RSE1YML049C 4086 nt3.64□□□□□ -1.83
HEF3P53978 BI3Q0115 1554 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 NAT1YDL040C 2565 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPS18AYDR450W 441 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 TDA10YGR205W 873 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YAR075WYAR075W 474 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YLR339CYLR339C 552 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 MER1YNL210W 813 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YOL106WYOL106W 354 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 ERV15YBR210W 429 nt3.63□□□□□ -1.83
HEF3P53978 ULP1YPL020C 1866 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 EPO1YMR124W 2832 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 NSP1YJL041W 2472 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SMI1YGR229C 1518 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 UBC9YDL064W 474 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YDL158CYDL158C 309 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 BMH2YDR099W 822 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPN9YDR427W 1182 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RPS25AYGR027C 327 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 THP2YHR167W 786 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YVH1YIR026C 1095 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 ATG27YJL178C 816 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 COA4YLR218C 453 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 snR17asnR17a 333 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YPR050CYPR050C 414 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 VAS1YGR094W 3315 nt3.62□□□□□ -1.83
HEF3P53978 UTP25YIL091C 2166 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 LSM4YER112W 564 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 VMA7YGR020C 357 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SMA2YML066C 1110 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SIL1YOL031C 1266 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YPR027CYPR027C 834 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 GCN1YGL195W 8019 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YPR148CYPR148C 1308 nt3.61□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YJR030CYJR030C 2238 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YAR070CYAR070C 300 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 REH1YLR387C 1299 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YMR310CYMR310C 954 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 FIG1YBR040W 897 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YBR116CYBR116C 528 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 RRP5YMR229C 5190 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SEA4YBL104C 3117 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 GYP6YJL044C 1377 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SPT14YPL175W 1359 nt3.6□□□□□ -1.83
HEF3P53978 NRP1YDL167C 2160 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 REB1YBR049C 2433 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 DET1YDR051C 1005 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YEL010WYEL010W 351 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 PEF1YGR058W 1008 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 SRT1YMR101C 1032 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YPR078CYPR078C 1119 nt3.59□□□□□ -1.83
HEF3P53978 YGR117CYGR117C 1431 nt3.59□□□□□ -1.84
HEF3P53978 PMR1YGL167C 2853 nt3.59□□□□□ -1.84
HEF3P53978 SPT16YGL207W 3108 nt3.59□□□□□ -1.84
HEF3P53978 DSE1YER124C 1722 nt3.58□□□□□ -1.84
HEF3P53978 VPS33YLR396C 2076 nt3.58□□□□□ -1.84
HEF3P53978 YDR250CYDR250C 276 nt3.58□□□□□ -1.84
HEF3P53978 SRB7YDR308C 423 nt3.58□□□□□ -1.84
HEF3P53978 NSA2YER126C 786 nt3.58□□□□□ -1.84
HEF3P53978 YGR018CYGR018C 330 nt3.58□□□□□ -1.84
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