Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	RAS1	YOR101W	930 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YPL035C	YPL035C	348 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	DSE1	YER124C	1722 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	THR4	YCR053W	1545 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	TFB2	YPL122C	1542 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	SIN4	YNL236W	2925 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YCR099C	YCR099C	468 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YDL162C	YDL162C	357 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RUB1	YDR139C	234 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	EPT1	YHR123W	1176 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	SFH1	YLR321C	1281 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	UNG1	YML021C	1080 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	DLT1	YMR126C	1029 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PRP8	YHR165C	7242 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	XRN1	YGL173C	4587 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MIG1	YGL035C	1515 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	APA2	YDR530C	978 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	OST5	YGL226C-A	261 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YGR064W	YGR064W	369 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RSM27	YGR215W	333 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	UTP11	YKL099C	753 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	OCA2	YNL056W	594 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	HUA2	YOR284W	732 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YBR053C	YBR053C	1077 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PRM4	YPL156C	855 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YPR027C	YPR027C	834 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	DIB1	YPR082C	432 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PBP2	YBR233W	1242 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YDL158C	YDL158C	309 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RGI1	YER067W	486 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	CWC23	YGL128C	852 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	COX6	YHR051W	447 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MER1	YNL210W	813 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	DGA1	YOR245C	1257 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	GRX5	YPL059W	453 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MSM1	YGR171C	1728 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	SPH1	YLR313C	1593 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	ROM1	YGR070W	3468 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	ATP16	YDL004W	483 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PET100	YDR079W	336 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	HTB1	YDR224C	396 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	SVP26	YHR181W	687 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	CCE1	YKL011C	1062 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	SMD2	YLR275W	333 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MCT1	YOR221C	1083 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YOR366W	YOR366W	354 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RET3	YPL010W	570 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	DIM1	YPL266W	957 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	STT4	YLR305C	5703 nt		3.34	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.34	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	AI4	Q0065	1671 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PSF1	YDR013W	627 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	MPS2	YGL075C	1164 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YGL214W	YGL214W	486 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YGL242C	YGL242C	546 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YGR114C	YGR114C	390 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	FOL2	YGR267C	732 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SNX4	YJL036W	1272 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SWD2	YKL018W	990 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	COQ9	YLR201C	783 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PEX15	YOL044W	1152 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	CMD1	YBR109C	444 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	KIN3	YAR018C	1308 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	LTV1	YKL143W	1392 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	STU2	YLR045C	2667 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	HUL5	YGL141W	2733 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	MIX14	YDR031W	366 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	GUK1	YDR454C	564 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	DOG1	YHR044C	741 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	EMC2	YJR088C	879 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	GRX7	YBR014C	612 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PPT2	YPL148C	522 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	STP1	YDR463W	1560 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SCM4	YGR049W	564 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PTI1	YGR156W	1278 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	RPC25	YKL144C	639 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	IMP1	YMR150C	573 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	ERG2	YMR202W	669 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PEX11	YOL147C	711 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	MED8	YBR193C	672 nt		3.31	□□□□□ -1.88

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