Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOSBP53539 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOSBP53539 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOSBP53539 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOSBP53539 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FOSBP53539 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms