Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF135P52742 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF135P52742 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms