Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNA2P51530 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNA2P51530 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNA2P51530 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNA2P51530 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNA2P51530 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNA2P51530 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms