Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNTBP49356 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNTBP49356 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNTBP49356 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTBP49356 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms