Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK8P49336 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK8P49336 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK8P49336 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK8P49336 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK8P49336 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK8P49336 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms