Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms