Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms