Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRXP46100 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRXP46100 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRXP46100 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRXP46100 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRXP46100 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRXP46100 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRXP46100 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRXP46100 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRXP46100 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms