Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCAMP43121 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCAMP43121 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCAMP43121 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCAMP43121 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCAMP43121 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCAMP43121 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCAMP43121 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCAMP43121 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCAMP43121 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCAMP43121 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCAMP43121 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCAMP43121 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms