Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC5P40937 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC5P40937 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC5P40937 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC5P40937 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC5P40937 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC5P40937 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms