Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 SWI3YJL176C 2478 nt4.11□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 HUL5YGL141W 2733 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 RPO31YOR116C 4383 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YCR013CYCR013C 648 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 ARO2YGL148W 1131 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YGL159WYGL159W 1113 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 DSE2YHR143W 978 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 RPL17AYKL180W 555 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 ELA1YNL230C 1140 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 CUR1YPR158W 759 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YDL199CYDL199C 2064 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YGR117CYGR117C 1431 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 CIT1YNR001C 1440 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 ARP5YNL059C 2268 nt4.1□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 OAF3YKR064W 2592 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 DAP2YHR028C 2457 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YDR340WYDR340W 303 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YIL171WYIL171W 330 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 ERG3YLR056W 1098 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 KRE29YER038C 1395 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 TUB2YFL037W 1374 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YCT1YLL055W 1596 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 YML096WYML096W 1578 nt4.09□□□□□ -1.75
SSZ1P38788 RTC1YOL138C 4026 nt4.09□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 PBP4YDL053C 558 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 VAB2YEL005C 849 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RPF1YHR088W 888 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 NTA1YJR062C 1374 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 PNP1YLR209C 936 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SWC7YLR385C 399 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 OCA2YNL056W 594 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 TOA1YOR194C 861 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YOR203WYOR203W 354 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RPA43YOR340C 981 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 MRPS9YBR146W 837 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 FYV5YCL058C 459 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 MCD4YKL165C 2760 nt4.08□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RNA14YMR061W 2034 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 STE24YJR117W 1362 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YDL163WYDL163W 303 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 HOM2YDR158W 1098 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SPI1YER150W 447 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SLX9YGR081C 633 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 GOS1YHL031C 672 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 LRP1YHR081W 555 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 NMA1YLR328W 1206 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YLR428CYLR428C 345 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RPS19AYOL121C 435 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 UTP23YOR004W 765 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 TPA1YER049W 1935 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SEG1YMR086W 2883 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 TPO5YKL174C 1857 nt4.07□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YOL019WYOL019W 1656 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 ANR2YKL047W 1551 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 NOP12YOL041C 1380 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YDL016CYDL016C 303 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 MXR1YER042W 555 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YJL114WYJL114W 681 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 ILM1YJR118C 612 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SRP21YKL122C 504 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 PIR1YKL164C 1026 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YNL109WYNL109W 546 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YNL122CYNL122C 348 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YPL205CYPL205C 345 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 PTA1YAL043C 2358 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 NAT1YDL040C 2565 nt4.06□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 IOC2YLR095C 2439 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 JJJ1YNL227C 1773 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 JHD2YJR119C 2187 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RRP42YDL111C 798 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YDR271CYDR271C 372 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YIL165CYIL165C 360 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YJL007CYJL007C 315 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 SNX4YJL036W 1272 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RPS4AYJR145C 786 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 NKP2YLR315W 462 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RPL15BYMR121C 615 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YNL276CYNL276C 396 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 BUD21YOR078W 645 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YPR170CYPR170C 336 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 APD1YBR151W 951 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 CHK1YBR274W 1584 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 RAD54YGL163C 2697 nt4.05□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 MFA1YDR461W 111 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 TAM41YGR046W 1158 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 YKL070WYKL070W 510 nt4.04□□□□□ -1.76
SSZ1P38788 BUR2YLR226W 1188 nt4.04□□□□□ -1.76
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