Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGCXP38435 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGCXP38435 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGCXP38435 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGCXP38435 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGCXP38435 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGCXP38435 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms