Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL4P36578 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL4P36578 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL4P36578 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms